Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NME5P56597 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NME5P56597 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NME5P56597 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NME5P56597 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NME5P56597 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NME5P56597 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms