Protein–RNA interactions for Protein: P55318

FOXA3, Hepatocyte nuclear factor 3-gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA3P55318 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXA3P55318 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXA3P55318 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms