Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EPHB3P54753 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EPHB3P54753 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms