Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3M2P53677 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3M2P53677 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms