Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLCN3P51790 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLCN3P51790 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms