Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FNTBP49356 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FNTBP49356 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FNTBP49356 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FNTBP49356 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTBP49356 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTBP49356 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FNTBP49356 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FNTBP49356 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FNTBP49356 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms