Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NESP48681 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NESP48681 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NESP48681 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NESP48681 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NESP48681 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NESP48681 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NESP48681 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NESP48681 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NESP48681 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NESP48681 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NESP48681 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NESP48681 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NESP48681 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NESP48681 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
NESP48681 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NESP48681 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NESP48681 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NESP48681 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NESP48681 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NESP48681 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NESP48681 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms