Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP5P45974 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP5P45974 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP5P45974 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP5P45974 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP5P45974 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP5P45974 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms