Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE6BP35913 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms