Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SFTPDP35247 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SFTPDP35247 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms