Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CPS1P31327 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CPS1P31327 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CPS1P31327 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CPS1P31327 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CPS1P31327 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPS1P31327 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPS1P31327 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPS1P31327 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CPS1P31327 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPS1P31327 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPS1P31327 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPS1P31327 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPS1P31327 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms