Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA10P31260 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA10P31260 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms