Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD34P28906 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD34P28906 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD34P28906 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD34P28906 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD34P28906 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD34P28906 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms