Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBL1P28749 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBL1P28749 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBL1P28749 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBL1P28749 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms