Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRBP28702 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRBP28702 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RXRBP28702 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RXRBP28702 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RXRBP28702 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RXRBP28702 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RXRBP28702 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RXRBP28702 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms