Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSFA2P28290 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSFA2P28290 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms