Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IL3RAP26951 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IL3RAP26951 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms