Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	ERG28	YER044C	447 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	RPL14B	YHL001W	417 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	SUI2	YJR007W	915 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	END3	YNL084C	1050 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	HEM4	YOR278W	828 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	SEC66	YBR171W	621 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	AGE1	YDR524C	1449 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	SLF1	YDR515W	1344 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	VPS38	YLR360W	1320 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	LST4	YKL176C	2487 nt		2.91	□□□□□ -1.94
RPC53	P25441	MIC19	YFR011C	513 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YIP5	YGL161C	933 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	ERV1	YGR029W	570 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	PCL5	YHR071W	690 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YJR020W	YJR020W	333 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	snR191	snR191	274 nt		2.9	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	STI1	YOR027W	1770 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	URK1	YNR012W	1506 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	APC2	YLR127C	2562 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	UTP14	YML093W	2700 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	LOC1	YFR001W	615 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	EST3	YIL009C-A	546 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	MRP49	YKL167C	414 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	RAD18	YCR066W	1464 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	BUB1	YGR188C	3066 nt		2.89	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	FIR1	YER032W	2631 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SNA4	YDL123W	423 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YGR115C	YGR115C	780 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	RNR2	YJL026W	1200 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YPL119C-A	YPL119C-A	264 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	CUR1	YPR158W	759 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	FUS1	YCL027W	1539 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.88	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	RPO41	YFL036W	4056 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YCR013C	YCR013C	648 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	COX3	Q0275	810 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YLL044W	YLL044W	447 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YAR069C	YAR069C	294 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	IRC21	YMR073C	606 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SGT1	YOR057W	1188 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SME1	YOR159C	285 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SSP1	YHR184W	1716 nt		2.87	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	AYT1	YLL063C	1425 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	TAD1	YGL243W	1203 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	LIN1	YHR156C	1023 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YBR062C	YBR062C	543 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SUS1	YBR111W-A	291 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YBR287W	YBR287W	1284 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.86	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	UBC13	YDR092W	462 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YDR250C	YDR250C	276 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	RSM28	YDR494W	1086 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YMR31	YFR049W	372 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	ALY1	YKR021W	2748 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	PCK1	YKR097W	1650 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	PFF1	YBR074W	2931 nt		2.85	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	NTF2	YER009W	378 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YGL109W	YGL109W	324 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	YJL133C-A	YJL133C-A	225 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	NYV1	YLR093C	762 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	ECI1	YLR284C	843 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	TMA64	YDR117C	1698 nt		2.84	□□□□□ -1.95
RPC53	P25441	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.84	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YLR108C	YLR108C	1458 nt		2.84	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	SAP1	YER047C	2694 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	snR83	snR83	306 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	VPS63	YLR261C	327 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	POP7	YBR167C	423 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	NAB6	YML117W	3405 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	ESC2	YDR363W	1371 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.83	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	RLF2	YPR018W	1821 nt		2.82	□□□□□ -1.96
RPC53	P25441	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.82	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.1 ms