Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTAFRP25105 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms