Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL9A1P20849 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL9A1P20849 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms