Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
XBP1P17861 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
XBP1P17861 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
XBP1P17861 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
XBP1P17861 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
XBP1P17861 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms