Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
UBTFP17480 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
UBTFP17480 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
UBTFP17480 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
UBTFP17480 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
UBTFP17480 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UBTFP17480 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
UBTFP17480 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UBTFP17480 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
UBTFP17480 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms