Protein–RNA interactions for Protein: P14317

HCLS1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1P14317 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HCLS1P14317 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HCLS1P14317 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HCLS1P14317 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms