Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRG2P13727 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PRG2P13727 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRG2P13727 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRG2P13727 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRG2P13727 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRG2P13727 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms