Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT3P12035 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT3P12035 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT3P12035 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KRT3P12035 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT3P12035 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT3P12035 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT3P12035 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT3P12035 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KRT3P12035 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT3P12035 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT3P12035 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRT3P12035 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms