Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALAP11233 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALAP11233 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALAP11233 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALAP11233 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALAP11233 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RALAP11233 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RALAP11233 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALAP11233 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RALAP11233 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RALAP11233 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RALAP11233 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALAP11233 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALAP11233 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALAP11233 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALAP11233 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RALAP11233 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms