Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
PTPRCP08575 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTPRCP08575 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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