Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSP90AB1P08238 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSP90AB1P08238 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms