Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFNA4P05014 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms