Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NSD2O96028 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NSD2O96028 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NSD2O96028 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NSD2O96028 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NSD2O96028 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NSD2O96028 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NSD2O96028 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms