Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TOP3BO95985 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TOP3BO95985 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms