Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSCO60682 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSCO60682 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSCO60682 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSCO60682 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSCO60682 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms