Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
FOXO3O43524 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FOXO3O43524 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms