Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTIFO43310 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTIFO43310 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTIFO43310 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTIFO43310 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CTIFO43310 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTIFO43310 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTIFO43310 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTIFO43310 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTIFO43310 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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