Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CITO14578 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CITO14578 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CITO14578 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CITO14578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CITO14578 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CITO14578 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CITO14578 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CITO14578 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CITO14578 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms