Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOCS3O14543 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms