Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PTPRTO14522 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PTPRTO14522 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
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