Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DFFAO00273 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DFFAO00273 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DFFAO00273 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DFFAO00273 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DFFAO00273 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DFFAO00273 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DFFAO00273 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms