Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
STRCP1A6NGW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
STRCP1A6NGW2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms