Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C9orf92A6NGG3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
C9orf92A6NGG3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms