Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POTEFA5A3E0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POTEFA5A3E0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms