Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

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Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
XIRP2A4UGR9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XIRP2A4UGR9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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