Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCHNA4D1U4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms