Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A0U1RQJ8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RQJ8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms