Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms