Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
DCAF1Q9Y4B6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
DCAF1Q9Y4B6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
DCAF1Q9Y4B6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms