Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
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