Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CAB39Q9Y376 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAB39Q9Y376 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms