Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NINLQ9Y2I6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NINLQ9Y2I6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms