Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM35Q9UPQ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM35Q9UPQ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM35Q9UPQ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms